FAQ

high quality precision analysis

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기본 시퀀싱 (Basic Sequencing) 서비스

염기서열 분석기간은 얼마나 되나요?

Basic 샘플의 경우는 통상적으로 24시간이내에 결과를 받아보실 수 있습니다. gel extraction등 부가 서비스를 선택하신 샘플에 대해서는 하루정도 더 소요됩니다.

샘플 준비는 어떻게 해야 하나요?

plasmid DNA의 경우 한 반응당 100~200ng/ul, PCR product의 경우는 50~100ng/ul를 기본 10ul 정도를 1.5ml tube에 보내주시면 됩니다. (반응 수량에 따라 추가적으로 보내주시면 됩니다.)

Primer는 어떻게 준비하나요?

Specific primer의 경우 10pmole/ul 를 1.5ml tube에 10ul 정도 보내주시면 됩니다. (반응수가 추가 될때마다 10pmole씩 추가적으로 보내주시면 됩니다.)

결과 확인은 어디서 하나요?

홈페이지의 마이페이지 > 결과 확인을 통해서 결과를 다운로드 받으실 수 있습니다.

ab1파일은 어떻게 확인할 수 있나요?

별도의 viewer program(chromas , FinchTV)을 통해서 확인 가능합니다.

샘플 보관기간은 어떻게 되나요?

접수일을 기준으로 2주정도 보관되고 있습니다.

데이터 보관 기간은 어떻게 되나요?

결과 발송일을 기준으로 웹페이지에서 한달 정도 다운로드 가능합니다.

제공되는 primer는 어떤 것들이 있나요?

Basic sequencing 하단에 universal primer list를 통해서 무료로 제공되는 프라이머의 이름과 서열을 확인하실 수 있습니다.

ab1파일은 어떻게 확인할 수 있나요?

별도의 viewer program(chromas , FinchTV)을 통해서 확인 가능합니다
Chromas : https://technelysium.com.au/wp/chromas/
FinchTV : https://digitalworldbiology.com/FinchTV

Full Sequencing Service

Full sequencing이란?

의뢰하신 sample의 전체 염기서열을 분석해 드리는 서비스 입니다. Primer walking 방법으로 서비스는 진행되며 primer design-primer synthesis-sequencing analysis-assembly 일련의 과정을 진행합니다.

Full sequencing 후 어떤 결과물을 받을 수 있나요?

각 primer에 대한 partial raw data와 합성 프라이머에 대한 정보와 프라이머, 그리고 최종적으로 single contig파일을 보내드립니다.

Viral Genome Sequencing Service

Virus full sequencing 의뢰 시 필요한 사항이 무엇입니까?

Virus에 대한 sequencing의 경우 정확한 서열정보가 없기 때문에, 현재까지 보고된 서열을 기반으로 degenerate PCR 방법을 이용하여 전체 서열분석을 진행합니다. 따라서 정확한 virus 명을 알아야만 진행이 가능합니다.

Virus full sequencing 진행 시 전체 서열을 확인해주는 것인지요?

degenerate PCR을 이용하기 때문에, 말단의 서열은 정확히 분석이 불가능하며 내부의 ORF 서열만 확인이 가능합니다. 정확한 full sequence를 확인하고자 하는 경우 추가로 RACE PCR을 진행하여야 합니다.

mtDNA Sequencing Service

mtDNA sequencing 진행 시 어떤 결과를 제공해주시나요?

mtDNA의 경우 COI 분석을 통하여 NCBI에 등재된 근연종의 서열을 확인 후 이를 이용한 degenerate PCR로 전체 서열을 분석하게 됩니다. 분석 완료된 서열을 토대로 annotation되어진 genbank file을 제공해드립니다.

mtDNA sequencing 진행 시 기간에 대한 안내 부탁드립니다.

mtDNA의 분석의 경우 D-loop라고 하는 AT rich sequence가 존재하며, 이 구간에 대한 PCR 및 direct sequencing이 상당히 어렵습니다. 일반적으로 D-loop의 길이가 개체마다 차이가 있어서 이 부분의 분석여부에 따라 기간의 차이가 발생합니다. D-loop를 제외한 구간의 분석은 약 1달이면 가능합니다.

Bisulfite Sequencing Service

Bisulfite sequencing에 대한 안내 부탁드립니다.

Bisulfite sequencing은 bisulfite 처리 - PCR - TA cloning - 서열분석의 4단계로 진행됩니다. 각 단계별로 요금이 부과되기 때문에 원하시는 단계부터의 진행이 가능합니다.

Bisulfite sequencing 한 반응으로 최대 몇 bp의 분석이 가능한가요?

Bisulfite 처리시 C 서열이 T 서열로 치환되면서 부위별로 nick이 발생하기도 하며, single strand DNA의 형태가 되기 때문에, 일반적으로 300bp 정도의 구간으로 나눠서 진행하게 됩니다. 가장 좋은 크기는 약 200bp 정도이며, 너무 큰 경우 fragmentation에 의한 추가 비용이 발생합니다.

Bisulfite sequencing 진행 시 몇 개의 clone을 sequencing하는가요?

PCR을 통하여 methylation에 대한 분석을 진행하는데, 일반적으로는 10개의 clone에 대한 sequencing을 통하여 통계를 내고 있습니다. 통계의 유의성에 따라 원하시는 sequencing 반응수를 조정하실 수 있습니다. 이 경우 이에 대한 비용이 추가됩니다.

Bisulfite sequencing 결과는 어떻게 제공해주시는가요?

최종 sequencing 결과에 대한 raw data와 추출된 서열을 제공해드리고 있으며, 추출된 서열을 이용하여 BiQ analyzer라는 프로그램을 이용한 분석결과(dot, bar type)를 함께 제공해드립니다.

RACE PCR Service

RACE PCR에 대한 안내 부탁드립니다.

특정 구간에 대한 서열정보만 있는 경우 RNA의 양 말단에 대한 서열을 확인해드리는 서비스입니다. 알고 있는 서열구간을 이용하여 양 말단의 서열을 확인해드립니다. 3'RACE의 경우 A tail 유무에 따라 실험방법이 다르기 때문에 비용의 차이가 발생합니다.

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