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>고객지원>서비스 FAQ
미생물 동정 서비스는 Bacteria와 같은 세균과 Yeast, Fungi와 같은 진균류가 가지고 있는 ribosomal RNA를 coding 하고 있는 DNA 염기서열을 분석하는 서비스입니다. 분석된 염기서열은 NCBI GeneBank에 등재되어 다양한 미생물의 염기서열과 그 상동성을 비교 (BLAST Search)하여 최종적으로 미생물종의 분류 및 동정 결과가 제공됩니다. 바이오닉스에서는 분석대상이 되는 Target 부위의 PCR 반응에서, Sequencing 및 최종 동정결과까지 제공합니다.
순수 배양한 colony 형태( bacteria, Yeast) 나 genomic DNA 로 보내주시면 됩니다.
균주에 대한 정보가 없을때 (진균인지 세균인지 알 수 없을 때) unknown으로 의뢰하시면 됩니다. 단 이 경우는 세가지 specific primer를 이용하여 PCR (27F+1492R/ITS1+ITS4/NL1+NL4) 및 시퀀싱이 추가 진행됩니다.
align서비스란 수집된 유전서열에 대한 partial data를 하나로 assembly하는 것을 말하며, 이 assemble된 파일을 NCBI Genebank에 등재되어 있는 서열정보와 비교 분석하여, 가장 높은 유사성을 보이는 data를 보여주는 분석서비스입니다. 바이오닉스는 BLAST Search를 통해 상위 10개의 유사성을 보이는 균의 정보를 제공합니다.
동정하고자 하는 검체의 원하는 부위를 PCR 반응하고, 이 PCR산물을 Purification 한 후 sequencing까지 진행해주는 서비스입니다.
gDNA의 경우 2차 PCR까지 원활한 진행을 위하여 30ng/ul의 농도로 기본 5ul, primer는 5pmol 기준으로 10ul씩 제공해주셔야 합니다. primer를 제작부터 원하는 경우 reference sequence를 제공해주셔야 합니다. (단, sample의 종류가 cell이나 조직인 경우 사전 상담이 필요합니다)
기본적으로 .ab1, .seq, .pdf file이 제공되며 필요하신 경우 전기영동사진과 PCR cycle이 포함된 보고서를 제공합니다.
2영업일 이후부터 결과발송이 진행되며, 1차 PCR에서 밴드확인이 안되는 경우 2차 PCR까지 무료로 진행합니다.
Mycoplasma는 세포벽이 없는 매우 작은 원핵생물 (0.15-0.3 µm)로서, 육안은 물론 현미경으로도 관찰하기 어렵습니다. 일반적으로 배지의 큰 탁도변화를 일으키지 않고, 세포 사멸을 초래하지 않기 때문에 그 감염을 일반적인 관찰만 가지고 그 감염여부를 확인하기 어렵습니다.
세포 배양에서 Mycoplasma 감염이 발생할 경우 신뢰할 수 없는 실험적인 결과, 재현 불가능한 결과, 영구적인 세포주의 특성변화를 일으킬 수 있습니다. 따라서 가장 민감하고 신뢰할 수 있는 방법으로 세포주를 정기적으로 테스트하는 것이 필수적입니다.
Mycoplasma를 검출하는 방법에는 형광물질을 이용한 핵산염색법, 항체를 이용한 ELISA, Immunostaining과 핵산증폭을 이용하는 PCR (Standard, Realtime PCR)법이 있습니다. 이들 분석법중 바이오닉스에서는 다양한 subtype까지도 분석 가능한 PCR법을 통해 정확하고 민감한 분석 서비스를 제공하고 있습니다.
분석방법, 샘플의 수량, 핵산 추출 작업여부등 다양한 옵션이 발생하기 때문에, 당사 서비스팀과 사전 문의후에 진행하시면 됩니다.
